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Il virus dell'immunodeficienza umana di tipo 1 (HIV-1) muta rapidamente sotto le pressioni selettive dell'immunità dell'ospite, il che consente l'amplificazione delle mutazioni di fuga che permettono al virus di eludere la risposta immunitaria dell'ospite. Le prime sequenze tracciabili del sottotipo A dell'HIV-1 (nel repository delle sequenze) erano di origine africana e risalivano alla metà degli anni '80. Negli anni successivi, con la diffusione dei virus del sottotipo A a livello globale, iniziarono ad apparire anche sequenze provenienti da diverse parti del mondo. Negli ultimi decenni, l'HIV-1 sottotipo A si è diffuso in alcune regioni del mondo, tra cui Kenya, Uganda, Giappone, Azerbaigian, Belgio, Botswana, Bielorussia, Congo e, recentemente, Afghanistan e Pakistan. L'analisi dei modelli evolutivi di un virus nel contesto delle popolazioni ospitanti fa luce sulle pressioni di selezione sui virus associate a specifici ambienti immunitari dell'ospite. Questo tipo di informazioni è utile nella progettazione di vaccini e farmaci contro il virus.