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Una migliore comprensione della vitalità e della virulenza dei potenziali agenti patogeni endodontici può aiutare a spiegare il meccanismo e le diverse manifestazioni cliniche delle infezioni endodontiche e, di conseguenza, contribuire all'identificazione degli obiettivi terapeutici. Questo studio cerca di fornire una panoramica della vasta gamma di microflora che infetta il sistema canalare. Vengono discussi i fattori di virulenza e la risposta dell'ospite, insieme al meccanismo di insorgenza delle lesioni pulpare e periapicali. Sono stati discussi in modo approfondito gli attuali progressi nei metodi molecolari di isolamento e rilevamento di microrganismi precedentemente non identificati, insieme al ruolo dei biofilm nelle infezioni intra-radicolari ed extra-radicolari.