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Le coton est la culture fibreuse la plus importante au monde, qui soutient l'économie de plusieurs pays. Son huile de graines est également une source importante d'huile alimentaire utilisée à des fins culinaires. Le cotonnier est endommagé par un certain nombre d'insectes nuisibles qui non seulement réduisent son rendement, mais nuisent également à sa qualité. Les insectes évoluent très rapidement au fil du temps et de nouvelles races apparaissent, ce qui constitue une menace très sérieuse pour la production de coton et un défi de taille pour les sélectionneurs de coton. Pour relever ce défi, il est inévitable de développer des variétés résistantes aux insectes à l'aide de techniques de sélection modernes. La sélection assistée par marqueurs est un outil très précieux pour les sélectionneurs de plantes, qui peuvent l'utiliser pour développer des génotypes présentant une architecture génétique souhaitable. Cette méthode nécessite l'évaluation des traits phénotypiques et le génotypage à l'aide de marqueurs ADN. Les données des marqueurs ADN sont utilisées pour cartographier les QTL. Les techniques généralement utilisées pour cartographier les QTL dans les plantes cultivées sont la cartographie par intervalles simples, la cartographie par intervalles composites, la régression des marqueurs, la cartographie par intervalles composites simplifiée, les méthodes bayésiennes, l'analyse des locus à marqueur unique et la cartographie par intervalles multiples.