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Se ha confirmado la presencia de Helicobacter pylori en aguas residuales, lo que demuestra que existe un reservorio de H. pylori fuera del estómago humano. En el medio acuático, esta bacteria se transforma de su forma bacilar característica a una forma coccidea o coccobacilar, que no es cultivable. Sin embargo, se ha logrado cultivar esta bacteria por primera vez mediante el método MDCS. Existe una similitud entre la H. pylori encontrada en las aguas residuales y la obtenida de biopsias clínicas y agua potable, según indica la técnica RFLP, lo que plantea la posibilidad de una vía de transmisión fecal-oral.