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Trypanosoma cruzi, agent étiologique de la maladie de Chagas, est largement répandu sur le continent américain. Grâce à diverses techniques de biologie moléculaire, un dimorphisme clair a été observé entre les isolats, conduisant au regroupement des souches en deux grandes lignées phylogénétiques : T.cruzi I (qui correspond à ZI) et T.cruzi II (qui correspond à ZII). Un dendrogramme phylogénétique basé sur certaines cibles génomiques a révélé une dichotomie claire dans ZIII, définissant deux sous-groupes (ZIII-A et ZIII-B). Ainsi, l'analyse protéomique des souches appartenant à ZIII par rapport à T. cruzi I et II peut contribuer à élucider cette question. Ce travail a pour objectif principal de définir la carte des protéines solubles des souches appartenant au zimodème III (3663 - ZIII-A et 4167 - ZIII-B), en soulignant les différences existant entre les sous-groupes ZIII-A et ZII-B. Les résultats définissent la carte protéomique et la classification de certaines protéines d'isolats ZIII en tenant compte des sous-groupes génomiques circulant dans la nature.