Im Jahr 1987 verließ er seinen Stammverein Kania Gosty und schloss sich Lech Posen an, wo er damals bereits eines der herausragenden polnischen Talente bessere Trainingsmöglichkeiten hatte. Bereits mit 17 Jahren wurde er in der Saison 1987/88 in der ersten Mannschaft eingesetzt, ein Jahr später erzielte der immer noch Jugendliche seine ersten Liga-Tore. In seiner ersten vollen Spielzeit 1989/90 wurde Juskowiak mit 18 Toren polnischer Torschützenkönig. Bei den Olympischen Spielen 1992 in Barcelona als Torschützenkönig erstmals international ins Rampenlicht getreten, konnte Juskowiak bei Sporting Lissabon, wo er ab 1992 drei Jahre spielte, seinen Ruf als internationaler Top-Scorer untermauern. Seit 1996 spielt der Stürmer in Deutschland. Nach Stationen bei Klubs wie Borussia Mönchengladbach und VfL Wolfsburg spielte er von Januar 2004 bis 2007 beim FC Erzgebirge Aue.