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Esse trabalho foi proposto com o objetivo de contribuir com novas informações sobre o efeito da posição das vagens em diferentes partes da planta nas características físico-químicas e agronômicas, isso face à escassez dessas informações atualmente na literatura acadêmica. Dois experimentos foram instalados no campo experimental da Universidade Federal do Tocantins, em Palmas-TO, latitude 10º45' S, longitude 47º14' W, a 220m de altitude, com clima tipo Aw (tropical com estação seca), em Latossolo Vermelho Amarelo Distrófico nos anos agrícolas de 2011/12 e 2012/13 com 15 cultivares de soja adaptadas para baixa latitude. O trabalho foi dividido em três capítulos, sendo o primeiro uma revisão de literatura, o segundo sobre o efeito da posição de vagens para teor de óleo e proteína em diferentes partes da planta e terceiro apresentando o estudo de diversidade genética de cultivares de soja em diferentes partes da planta, a partir de características agronômicas e físico-químicas, através de análise multivariada pelo método de agrupamento de TOCHER, obtido a partir da distância de Mahalanobis.