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Una delle maggiori preoccupazioni legate ai sistemi di gestione agricola adottati dall'uomo risiede negli effetti sui processi biologici che avvengono nel suolo, la cui azione all'interno di ecosistemi finalizzati allo sfruttamento agricolo modifica l'intensità di tali processi a causa dell'utilizzo di pratiche volte esclusivamente alla massimizzazione della produzione vegetale. Una delle sfide della ricerca sulla biologia del suolo è proprio quella di comprendere gli impatti della gestione sulle complesse interazioni di tutti gli organismi edafici a livello di comunità, fondamentali per mantenere la qualità del suolo.