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L'une des préoccupations majeures liées aux systèmes de gestion agricole adoptés par l'homme réside dans les effets sur les processus biologiques qui se déroulent dans le sol, dont l'action au sein des écosystèmes destinés à l'exploitation agricole modifie l'intensité de ces processus en raison de l'utilisation de pratiques visant exclusivement à maximiser la production végétale. L'un des défis de la recherche en biologie du sol est précisément de comprendre les impacts de la gestion sur les interactions complexes de tous les organismes édaphiques au niveau des communautés qui sont fondamentales pour le maintien de la qualité du sol.