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Os tomates são uma importante fonte de antioxidantes, tais como carotenóides, incluindo licopeno e beta-caroteno, vitamina C, vitamina E e polifenóis, como kaempferol e quercetina, com uma notável capacidade de eliminar espécies de oxigénio ativo (AOS). A caracterização e quantificação da diversidade genética tem sido, desde há muito, um dos principais objetivos da biologia evolutiva. A análise da variação genética, tanto dentro como entre materiais de reprodução de elite, é de interesse fundamental para os criadores de plantas. Os marcadores moleculares provaram ser ferramentas poderosas na avaliação da variação genética e na elucidação da relação genética dentro e entre espécies. Nesta dissertação, avaliámos os principais fitoquímicos do tomate, com especial atenção aos compostos que desempenham um papel significativo na determinação da atividade antioxidante, bem como do valor nutricional do tomate. Além disso, descobrimos as relações filogenéticas das linhas de tomate utilizando SDS-PAGE e marcadores RAPD.