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Il crescente problema dei danni causati dai Begomovirus in colture economicamente importanti ha generato un notevole impatto ecologico, sociale e culturale. La loro incidenza e gravità sta diventando sempre più allarmante in diversi sistemi di produzione agricola, con il pomodoro come ospite principale. Per questo motivo, da diversi anni sono emerse tecniche molecolari e genetiche volte a comprendere con precisione i meccanismi d'azione e di risposta che avvengono durante l'interazione pianta-virus. L'obiettivo è quello di chiarire i processi coinvolti nell'espressione fisiologica della pianta e del patogeno e, da qui, contrastare, inibire, mitigare e/o eliminare le malattie trasmesse da questo e altri tipi di virus. Questo documento monografico presenta informazioni di base sulle caratteristiche dei Begomovirus, sul loro meccanismo di infezione e sulle attuali tecniche molecolari raggruppate nell'ambito degli strumenti "omici" per la gestione e il controllo di questi patogeni. Si spera che questo documento possa essere utile per la comprensione delle principali malattie virali delle piante.