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Todos os geólogos se interrogam sobre a origem de uma formação geológica e dos minerais que a constituem e dos quais deriva. Nas formações sedimentares, muitos exemplos de minerais e minérios observados no campo e estudados em laboratório têm uma origem microbiana ou estreitamente associada, e muitos investigadores geológicos, microbiologistas, biólogos, geoquímicos e químicos concordam atualmente que os micróbios podem desempenhar um papel direto na mineralização, mas sobretudo um papel importante no aprisionamento e na concentração dos metais. Estudos efectuados em certos horizontes carbonatados com oóides, níveis ricos em sulfuretos do Jurássico Superior de Ali Sabieh, pseudo-pisólitos e oóides pseudo-ferrosos do Cretácico de Ali Sabieh, travertinos hidrotermais carbonatados do Lago Abhé e do Lago Asal e bolas de sal do Lago Asal, revelaram uma mineralização resultante de metabolismos microbianos. Entre 1982 e 1985, estudos sedimentológicos efectuados sobre bauxites do Cretácico médio e ferro-fosfatos do Terciário da Grécia continental demonstraram uma relação estreita entre estromatólitos, oóides e estes minerais.