Ogni geologo si interroga sull'origine di una formazione geologica e sui minerali che la compongono e da cui deriva. Nelle formazioni sedimentarie, molti esempi di minerali e minerali osservati sul campo e studiati in laboratorio hanno un'origine microbica o strettamente associata, e molti ricercatori geologici, microbiologi, biologi, geochimici e chimici concordano attualmente sul fatto che i microbi possono svolgere un ruolo diretto nella mineralizzazione, ma soprattutto un ruolo importante nell'intrappolare e concentrare i metalli. Studi effettuati su alcuni orizzonti carbonatici con ooidi, su livelli ricchi di solfuri del Giurassico superiore ad Ali Sabieh, su pseudopisoliti e pseudo ooidi di ferro del Cretaceo ad Ali Sabieh, su travertini idrotermali carbonatici del lago Abhé e del lago Asal e su sfere di sale del lago Asal, hanno evidenziato una mineralizzazione derivante da metabolismi microbici. Tra il 1982 e il 1985, studi sedimentologici condotti sulla bauxite del Cretaceo medio e sui ferro-fosfati terziari della Grecia continentale hanno dimostrato una stretta relazione tra stromatoliti, ooidi e questi minerali.
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