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Es necesario introducir estrategias para la conservación de los recursos genéticos del ganado en varias de sus formas. La información recopilada de diversas fuentes, a saber, conocimientos socioeconómicos, conocimientos y circunstancias indígenas, sistemas de producción, estudios fenotípicos, genotípicos y moleculares, puede utilizarse de manera fructífera y productiva para apoyar y respaldar las medidas de las estrategias de conservación. La caracterización morfológica y genética de las razas ovinas autóctonas es de enorme importancia y se puede lograr mediante la comprensión y la investigación de las asociaciones genéticas entre la población a través del análisis de las frecuencias alélicas en diferentes loci. Para ello, se aplican con frecuencia una serie de marcadores genéticos como VNTR, SNP y SSR. Los marcadores SSR pueden utilizarse para obtener resultados especializados para investigar la estructura y la composición de una población específica. Debido a características como la neutralidad, el alto polimorfismo, la codominancia y la dispersión uniforme a nivel genómico, los microsatélites se aplican con frecuencia en diversas especies para la caracterización genética. Los microsatélites (SSR) son loci extremadamente variables que proporcionan información genética adecuada.