É necessário introduzir estratégias para a conservação dos recursos genéticos do gado em várias das suas formas. As informações recolhidas a partir de várias fontes, nomeadamente conhecimentos socioeconómicos, compreensão e circunstâncias indígenas, sistema de produção, estudos fenotípicos, genotípicos e moleculares, podem ser utilizadas de forma frutífera e produtiva para apoiar e sustentar medidas para estratégias de conservação. A caracterização morfológica e genética das raças ovinas nativas é de imensa importância, o que pode ser alcançado através da compreensão e investigação das associações genéticas entre populações, por meio da análise das frequências alélicas em diferentes loci. Para esse fim, vários marcadores genéticos são frequentemente aplicados, como VNTRs, SNP e SSR. Os marcadores SSR podem ser usados para obter resultados especializados para investigar a estrutura e composição de uma população específica. Devido a características como neutralidade, alto polimorfismo, codominância e dispersão uniforme a nível genómico, os microssatélites são frequentemente aplicados em várias espécies para caracterização genética. Os microssatélites (SSR) são loci extremamente variáveis que disponibilizam informações genéticas adequadas.
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