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Se descubrió que el Bhut Jolokia estaba infectado por un complejo de enfermedades víricas causadas por cuatro virus, a saber, el virus del mosaico del pepino (CMV), el virus Y de la patata (PVY), el virus de la necrosis de la yema del maní (GBNV) y el virus del rizado de la hoja del chile (ChLCV). La incidencia y la detección de los virus se llevaron a cabo sobre la base de la sintomatología, el insecto vector, el DAS-ELISA y la PCR. Se adoptó un enfoque integrado para gestionar el complejo de enfermedades, que incluía diversos tratamientos, como tratamientos de semillas, tratamientos en viveros y tratamientos en el campo principal, en diferentes combinaciones.