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La ortología y la paralogía son conceptos centrales en biología evolutiva. La predicción de ortólogos (genes homólogos que divergieron debido a la especiación) y paralogos (genes homólogos que divergieron debido a la duplicación) es una parte integral de muchos métodos de genómica comparativa. Existen varios métodos para inferir la ortología y la paralogía. La ortología y la paralogía pueden inferirse utilizando métodos basados en gráficos y métodos basados en la filogenética. Sin embargo, se sabe que los métodos basados en análisis filogenéticos se asemejan mucho a la definición original de…mehr

Produktbeschreibung
La ortología y la paralogía son conceptos centrales en biología evolutiva. La predicción de ortólogos (genes homólogos que divergieron debido a la especiación) y paralogos (genes homólogos que divergieron debido a la duplicación) es una parte integral de muchos métodos de genómica comparativa. Existen varios métodos para inferir la ortología y la paralogía. La ortología y la paralogía pueden inferirse utilizando métodos basados en gráficos y métodos basados en la filogenética. Sin embargo, se sabe que los métodos basados en análisis filogenéticos se asemejan mucho a la definición original de ortología y paralogía. En el presente trabajo, se ha desarrollado un proceso para la detección de ortólogos y paralogos basado en el enfoque filogenético. Se descargó un conjunto de proteínas de UniProt y se creó una base de datos. Se detectaron ortólogos y paralogos para la secuencia de la proteína de consulta. Se utilizaron el algoritmo de solapamiento de especies y el umbral de distancia patrística por pares para identificar con precisión y ajustar la predicción de parálogos y ortólogos. Se desarrolló una interfaz fácil de usar.
Autorenporträt
Manpreet Singh a plus de 14 ans d'expérience dans le domaine de la biologie informatique. Il s'intéresse notamment aux méthodes d'apprentissage automatique en bioinformatique, à l'analyse des données en biologie végétale et aux méthodes informatiques dans le domaine de la sélection des cultures.