El diagnóstico de parásitos protozoarios requiere pruebas altamente sensibles y específicas; está surgiendo la cuestión del impacto en la salud pública de las especies y genotipos de Cryptosporidium y Giardia. Por este motivo, existe una necesidad urgente de determinar el alcance de la diversidad genética dentro de las cepas que afectan a los seres humanos o los animales, con el fin de comprender la epidemiología molecular de Cryptosporidium y Giardia. Este estudio está diseñado principalmente para diagnosticar la infección de algunos protozoos entéricos mediante métodos recientes. También se utilizaron técnicas moleculares como RAPD-PCR y genotipado, y se elaboró un árbol filogenético. Resultados: Se realizó un ensayo inmunológico mediante tres pruebas. En primer lugar, ELISA directo en C. parvum, con una especificidad del 79,1 % y una sensibilidad del 81,1 %. En segundo lugar, prueba rápida en tira para G. duodenalis y E. histolytica, con una especificidad del 73,8 % y una sensibilidad del 76,8 % para G. duedenalis. En E. histolytica, la especificidad fue del 52,7 % y la sensibilidad del 42,8 %. En tercer lugar, la prueba de inmunodifusión en gel de agar, con una especificidad del 39,4 % y una sensibilidad del 8,33 %. Identificación molecular mediante RAPD-PCR y genotipado, se construyó un árbol filogenético para Cryptosporidium parvum y Giardia duodenalis de ganado bovino.
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