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L'HIV ha una diversità genetica pari alla complessità della sua gestione. Il gruppo M (Major) è il gruppo dominante in Africa centrale. La distribuzione di questo gruppo in Africa e nella Repubblica Democratica del Congo (RDC), in particolare, è molto eterogenea; segue un algoritmo complesso e specifico. Questa distribuzione è molto dinamica, in evoluzione e imprevedibile; continuerà a diversificarsi finché il virus circola. La distribuzione geografica delle varianti di HIV-1 nella RDC è anche strettamente legata alla distribuzione delle varianti nei paesi vicini. Nei paesi vicini a nord-est, i ceppi predominanti sono D, C, A e B. Mentre nei paesi vicini a sud-est, i ceppi dominanti sono A, C e D. A Kinshasa, come in tutto il paese, è un vero mosaico, è diverso a seconda delle province. Nel corso degli anni, alcuni sottotipi sono stati confermati mentre altri sono svaniti a causa della pressione e delle diverse selezioni. L'epidemia molecolare di HIV-1 a Kinshasa suggerisce una persistenza del sottotipo A e un aumento significativo di CRF02_AG nella popolazione generale nel corso degli anni.