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Gli elementi cis-regolatori (CRE) come i promotori e gli enhancer sono candidati cruciali per la regolazione dell'espressione genica. Grazie alla cooperazione delle sequenze cis-regolatorie con i corrispondenti fattori di trascrizione, il comportamento o il destino del prodotto genico possono essere alterati in varie condizioni, ad esempio in caso di stress o in diverse fasi dello sviluppo. Piccole mutazioni/delezioni all'interno di queste sequenze possono portare alla diversità fenotipica a livello di specie. Uno studio completo sui CRE amplierà la gamma di promotori disponibili per l'uso nelle biotecnologie vegetali. I recenti progressi della bioinformatica hanno aperto nuove prospettive per la scoperta di nuovi promotori e dei loro elementi cis, che possono essere ulteriormente migliorati con lo sviluppo di metodi computazionali più robusti.