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Die Grenzen der endodontischen Desinfektion sind auf den Biofilm-Modus der Bakterien im Wurzelkanalsystem, die anatomische Komplexität, die Struktur/Zusammensetzung des Dentins und die Grenzen chemischer Desinfektionsmittel zurückzuführen. Daher werden in der Endodontie fortschrittliche Desinfektionsstrategien entwickelt und getestet. Das Hauptziel dieser fortschrittlichen Anti-Biofilm-Strategien ist die Eliminierung von Biofilmbakterien aus den uninstrumentierten Teilen und anatomischen Komplexitäten des Wurzelkanalsystems, ohne dass es zu unerwünschten Auswirkungen auf gesundes Gewebe kommt. Hier werden verschiedene schwierige Faktoren bei der Wurzelkanaldesinfektion und verschiedene fortschrittliche therapeutische Strategien für endodontische Biofilme wie antibakterielle Nanopartikel, antimikrobielle photodynamische Therapie, laserunterstützte Wurzelkanaldesinfektion, Ozon und pflanzliche/enzymatische Alternativen diskutiert.