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Los abscesos cerebrales atípicos como los tuberculosos, toxoplasmosis, Nocardia, Actinomyces y abscesos cerebrales fúngicos ocurren sobre todo en pacientes inmunodeprimidos, especialmente en varias regiones endémicas del mundo. Las características clínicas de estos abscesos cerebrales suelen ser insidiosas e inespecíficas. La naturaleza atípica e inespecífica de las imágenes de estos abscesos cerebrales, incluidas las tomografías computarizadas y las resonancias magnéticas cerebrales, así como otras dificultades diagnósticas, pueden causar retrasos en el diagnóstico, pero con la aplicación de modalidades como las imágenes ponderadas por difusión (DWI) y la espectroscopia de resonancia magnética, los abscesos cerebrales atípicos pueden diferenciarse rápidamente de los abscesos cerebrales bacterianos piógenos, los granulomas, los tumores cerebrales y entre sí. La identificación microbiológica también ha progresado con los avances de la microbiología molecular, la medicina nuclear y la inmunología, lo que hace posible y más fácil la diferenciación de los diversos organismos causantes. Los malos resultados generales existentes pueden mejorarse si el clínico identifica los factores de riesgo positivos y las apariencias radiológicas sugestivas e instituye precozmente el tratamiento adecuado.