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La caractérisation du matériel génétique (réserve d'informations génétiques) peut être réalisée à l'aide d'analyses morphologiques, biochimiques ou moléculaires. L'analyse moléculaire utilisant l'ADN génomique est fiable, car elle peut être effectuée à n'importe quel stade de développement de la plante et permet de comparer efficacement tous les accessions. Les marqueurs SSR (Simple Sequence Repeats) utilisés se sont révélés très instructifs pour étudier les relations entre des espèces végétales étroitement apparentées, ainsi que pour détecter facilement l'hérédité codominante et présenter un niveau élevé de polymorphisme par locus. 126 accessions de millet perlé ont été collectées dans le nord du Ghana, région où est produite la majeure partie du millet perlé du pays. Elles ont été regroupées en trois classes : maturation précoce, moyenne et tardive. 36 marqueurs SSR du millet perlé ont été utilisés pour génotyper 119 des accessions, ce qui a révélé une moyenne de 8,8 allèles par locus (fourchette de 3 à 20). Les résultats obtenus indiquent un polymorphisme élevé dans les accessions. La taille des allèles variait de 98 pb à 377 pb. Une combinaison de données moléculaires et morpho-agronomiques a permis de sélectionner 30 accessions qui serviront de source génétique locale et spécifique à certains traits pour améliorer le travail de sélection du millet perlé au Ghana.