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Dai risultati di questo studio si può concludere che il tasso di infezione degli endoprotozoi è stato più alto nei pesci d'acqua dolce di allevamento rispetto ai pesci selvatici (lago Borullus), inoltre la stagione estiva ha registrato il tasso di infezione più alto e i protozoi più prevalenti nella stagione estiva sono stati Eimeria spp ed Entamoeba in O. niloticus mentre in C. gariepinus i parassiti ematici sono stati gli endoprotozoi più isolati Trypansoma e Babesia. Lo stato di salute dei pesci esaminati (Oreochromis niloticus e Clarias garipinus) è stato influenzato in modo significativo da parametri dell'acqua come i composti azotati e lo stato batteriologico. I valori della conta batterica totale e dei coliformi totali sono risultati correlati positivamente con i fertilizzanti organici. Sono state riscontrate correlazioni positive tra l'acqua (composti azotati e stato batteriologico) e il tasso di infezione degli endoprotozoi. La concentrazione di metalli pesanti (Fe, Mn, Zn, Cu, Pb, Cd e Hg) nell'acqua è risultata più elevata nelle aziende agricole rispetto al lago Borullus. Nessuna correlazione tra il tasso di infezione e i livelli di metalli pesanti nell'acqua. La concentrazione di metalli pesanti negli organi segue la sequenza fegato > branchie > muscoli. Correlazione negativa tra i residui di metalli pesanti nei tessuti dei pesci e il tasso di infezione.