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Une maladie auto-immune se développe lorsque votre système immunitaire, qui défend votre organisme contre les maladies, considère vos cellules saines comme étrangères. En conséquence, votre système immunitaire attaque les cellules saines. Selon le type, une maladie auto-immune peut toucher un ou plusieurs types de tissus corporels. Elle peut également entraîner une croissance anormale des organes et des modifications de leur fonction. Une maladie auto-immune est donc un état pathologique résultant d'une réponse immunitaire anormale de l'organisme à des substances et des tissus normalement présents dans le corps. L'auto-immunité, en revanche, est la présence d'une réponse immunitaire auto-réactive (par exemple, des auto-anticorps, des lymphocytes T auto-réactifs), avec ou sans lésions ou pathologie qui en résulte. Elle peut se limiter à certains organes (par exemple dans le cas de la thyroïdite auto-immune) ou toucher un tissu particulier à différents endroits (par exemple la maladie de Goodpasture, qui peut affecter la membrane basale des poumons et des reins).