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La investigación se ha centrado en la identificación de nuevos patógenos ocultos que podrían contribuir a la patogénesis de la enfermedad periodontal. La periodontitis crónica parece tener una etiología bacteriana compleja. A pesar de las avanzadas modalidades terapéuticas dirigidas a la eliminación completa de los patógenos periodontales, la prevalencia de las enfermedades periodontales va en aumento. El advenimiento de métodos moleculares como la PCR, las técnicas de hibridación y las sondas de ADN ha hecho posible la identificación de especies no cultivadas. Los nuevos patógenos incluidos en la filogenia periodontal son Cryptobacterium curtum, Dialister pneumosintes, Filifactor alocis, Mitsuokella dentalis, Slackia exigua, Selenomonas sputigena, Solobacterium moorei, Treponema lecithinolyticum y Synergistes. Estos patógenos recién identificados se clasificaron en función de la asociación significativa con la periodontitis en niveles de asociación superior, moderado e inferior.
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