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L'ipotiroidismo congenito è una produzione inadeguata di ormoni tiroidei nei neonati. Può verificarsi a causa di un difetto anatomico della ghiandola, di un errore innato del metabolismo tiroideo o di una carenza di iodio. È chiamato cretinismo. L'ipotiroidismo congenito (CHT) è una condizione che deriva da una ghiandola tiroidea assente o poco sviluppata (disgenesia) o da una ghiandola che si è sviluppata ma non è in grado di produrre ormoni tiroidei a causa di un problema di "linea di produzione" (disormonogenesi). I bambini affetti da CHT non sono in grado di produrre una quantità di ormone tiroideo sufficiente per le esigenze dell'organismo. Il termine "congenito" significa che la condizione è presente alla nascita.