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O processo de urbanização pelo que vem passando os grandes centros urbanos tem afetado de forma bastante drástica a quantidade, e principalmente a qualidade das águas. A Bacia Hidrográfica do Ribeirão Guaraçau, localizada no compartimento norte do município de Guarulhos contempla áreas rural e urbana com diferentes classes de uso da terra. Para avaliar a qualidade ambiental, foram realizadas análises físico-químicas de temperatura, pH, turbidez, condutividade e fósforo total, bem como a análise microbiológica (E. coli) num período de 12 meses. As águas superficiais do córrego Guaraçau, na área rural já se encontra comprometida, com uma piora na qualidade da água de montante à jusante, para os parâmetros fósforo total e E. coli, indicando contaminação fecal devido à falta de saneamento básico na região. Locais característicos de área rural já apresentam sérios sinais de degradação com níveis de trofia variando de oligotrófico a hipereutrófico. Reforça-se a necessidade da construção de rede coletora e tratamento de esgoto na ETE Bonsucesso, inaugurada em 2011, e o controle de ocupações em áreas que são produtoras de água de boa qualidade.