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Insbesondere molekulare Marker, Mikrosatelliten oder einfache Sequenzwiederholungen (SSRs), wurden als markergestützte Selektionstechnik (MAS) eingesetzt, um die Salztoleranz von Reis zu bestimmen. Diese Technik beschleunigt den Reis-Züchtungsprozess, indem sie die Selektionseffizienz erheblich verbessert. Vierzig Sorten wurden verwendet, um die Auswirkungen von Salzstress auf das Keimlingswachstum und die Effizienz von SSR-Markern für das Screening salztoleranter Sorten zu untersuchen. Die Phänotypisierung der Sorten im Keimlingsstadium erfolgte unter kontrollierten Bedingungen im Gewächshaus des Bangladesh Institute of Nuclear Agriculture (BINA) unter Verwendung einer salzhaltigen (EC=12ds/m) Nährlösung. Salztolerante Sorten zeigten ein verkümmertes Wachstum mit einer Verringerung der Blattfläche im Vergleich zu den Sorten unter nicht salzhaltigen Bedingungen. Die aus normalen Samen gezüchteten Sämlinge waren kräftiger als die Sämlinge aus Samen unter salzhaltigen Bedingungen. Dieses Ergebnis deutete auf eine Beeinträchtigung der Keimkraft aufgrund von Salzstress hin.