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Las operaciones de post-cosecha correctamente realizadas garantizan una mejor calidad fisiológica de las semillas de girasol, pero para ello, después de la cosecha, se debe tener el debido cuidado con las transformaciones, deterioros y pérdidas debidas a la transferencia simultánea de calor y masa entre las semillas y el aire calentado en los procesos de secado, controlando la temperatura del aire de secado y la masa de las semillas, la humedad relativa y el flujo de aire en el secador. Un descuido en el proceso de secado puede dañar las estructuras celulares, desnaturalizar las proteínas y provocar grietas y cambios de color, reduciendo la calidad física y fisiológica de las semillas. En el almacenamiento, es fundamental controlar el contenido de agua de las semillas, teniendo en cuenta la humedad de equilibrio higroscópico para el almacenamiento y manteniendo la masa de las semillas a bajas temperaturas, reduciendo el proceso de respiración de la planta.