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Tal como outros animais, as aves desenvolveram um sistema imunitário capaz de responder e proteger contra agentes patogénicos como Escherichia coli, Salmonella sp. Pasteurella multocida, coronavírus e vírus da gripe aviária A. O sistema imunitário divide-se geralmente em dois ramos principais: as respostas imunitárias adaptativas (específicas) e as inatas (não específicas). Os componentes do sistema imunitário (ou seja, adaptativo e inato) incluem os linfócitos T, os linfócitos B, os macrófagos, as células assassinas naturais (NK), os heterófilos, os basófilos, diversos factores de comunicação humoral, como os eicosanóides e as citocinas (por exemplo, interleucinas, interferões, fator de necrose tumoral) e moléculas efectoras (por exemplo, imunoglobulinas, complemento, lisozimas, óxido nítrico). Além disso, alguns tecidos do corpo estão dedicados a apoiar o sistema imunitário, como as células dendríticas, reticulares e estromais. A regulação, interação e comunicação entre os vários elementos das respostas imunitárias específicas e inatas fazem com que as aves possuam um sistema imunitário altamente sofisticado, capaz de proteger contra agentes patogénicos invasores.