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Il termine analisi strutturale sarà utilizzato per riferirsi alle innovative equazioni della spettrometria di massa con dinamica stocastica utilizzate per determinare le strutture molecolari tridimensionali dei metaboliti della caffeina e prevederne teoricamente gli spettri di massa. Lo studio esamina la caffeina; acido urico, acido 1-metil-, 1,2-, 1,7- e 3,7-dimetil-urico; xantina; 1-, 3- e 7-metil-xantina; para- e idrossi-xantine; teacrino; teobromina; guanina; timina; e teofillina, rispettivamente. Utilizza la spettrometria di massa con ionizzazione elettrospray ad altissima risoluzione e la spettrometria di mobilità ionica; metodi statici chimico-quantistici ad alta precisione e dinamica molecolare basati sulla teoria ab initio e del funzionale della densità. La chemiometria valuta il grado di corrispondenza statistica tra i dati osservabili e teorici su queste equazioni e i misurandi degli analiti.