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La Naegleria fowleri, l'"ameba mangia-cervello", causa la fatale meningoencefalite amebica primaria (PAM). In questo studio, i campioni di liquor di 80 pazienti con sospetta PAM sono stati analizzati per indicatori chiave come la conta dei leucociti, il glucosio, le proteine e la microscopia. Mentre 79 sono risultati negativi, uno è stato confermato positivo per N. fowleri mediante PCR e microscopia. Sorprendentemente, i comuni test sul liquor (proteine elevate, glucosio basso, TLC elevata) non sono riusciti a distinguere la PAM da altri tipi di meningite, evidenziando la necessità di PCR e microscopia wet prep per una diagnosi accurata. Il campione positivo è stato coltivato su agar non nutritivo (NNA) e il sequenziamento mitocondriale ha identificato N. fowleri. La genotipizzazione ha rivelato il genotipo 2 di N. fowleri, che rappresenta la prima segnalazione in Pakistan. La sorveglianza ambientale delle forniture idriche di Karachi ha identificato N. fowleri in 11 località, compresa la casa del paziente, collegando l'acqua contaminata all'infezione. Dal 2011, tutti i casi di PAM a Karachi sono stati riportati qui. Questo studio fornisce dati genotipici essenziali ed esorta a migliorare il monitoraggio della qualità dell'acqua, la consapevolezza pubblica e l'aggiornamento delle infrastrutture per combattere questa malattia mortale.