La procalcitonina puede utilizarse para diferenciar entre infección bacteriana y vírica de las vías respiratorias y para determinar la duración del tratamiento antibiótico, para el diagnóstico y seguimiento de pacientes con sepsis y shock séptico y para estimar su pronóstico, para monitorizar la respuesta al tratamiento antibiótico, para detectar infecciones en pacientes posquirúrgicos y postrasplante de órganos, en pacientes con quemaduras graves, fallo multiorgánico y traumatismos graves, para el diagnóstico de la sepsis en todas las edades, incluidos los pacientes neutropénicos, para el diagnóstico diferencial de la meningitis bacteriana frente a la vírica y para el diagnóstico de la artritis séptica, para la detección de la afectación renal en niños que sufren infecciones urinarias.
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