Dan Deblasio, John Kececioglu

Parameter Advising for Multiple Sequence Alignment (eBook, PDF)

• Format: PDF

Produktbeschreibung

Presents practical approaches to the pervasive question of how to choose parameter settings for sequence alignment

Provides links to proven software implementations that work well on real data

Introduces a general framework for parameter advising of broad utility in bioinformatics and beyond

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Produktdetails

• Verlag: Springer International Publishing
• Seitenzahl: 152
• Erscheinungstermin: 4. Januar 2018
• Englisch
• ISBN-13: 9783319649184
• Artikelnr.: 53061525

Inhaltsangabe

1 Introduction and Background.- 2 Alignment Accuracy Estimation.- 3 The Facet Estimator.- 4 Computational Complexity of Advising.- 5 Constructing Advisors.- 6 Parameter Advising for the Opal Aligner.- 7 Ensemble Mind Alignment.- 8 Adaptive Local Realignment.- 9 Core Column Prediction for Alignments.- 10 Future Directions.